Classé Monument Historique, labellisé ' maison des illustres ', le musée propose un parcours à travers l'histoire des sciences, des cabinets de curiosité aux premiers Muséums, en s'attachant à deux personnalités nées à Montbard : George-Louis Leclerc, comte de Buffon (1707-1788) et Louis Jean-Marie Daubenton (1716-1800). Tous les ans, une exposition temporaire s'insère aux collections dans les différentes salles du musée pour proposer une découverte de l'héritage artistique et scientifique des deux célèbres naturalistes.
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